Включен в список журналов, статьи в которых учитываются Высшей аттестационной комиссией при защите диссертаций. Биологический отдел индексируется в нескольких продуктах платформы Web of Science: BIOSIS (BIOSIS Previews и BIOSIS Citation Index), Biological Abstracts, Zoological Record, а также в запущенном в Russian Science Citation Index.

Предназначен для публикации данных научных исследований и всестороннего рассмотрения, анализа и обсуждения вопросов глобальной экологии. Входит в перечень российских рецензируемых научных журналов, в которых должны быть опубликованы основные научные результаты диссертаций на соискание ученых степеней доктора и кандидата наук; базы данных EBSCO Environment Complete Databse, AGRIS

Публикует результаты исследований в различных областях фундаментальной ботаники: систематики, филогении, флористики, геоботаники, морфологии, структурной ботаники, физиологии растений; статьи, посвященные охране растительного мира. Включен в Перечень ВАК для опубликования работ соискателей ученых степеней, а также в международные базы данных: EBSCO, CABI, GeorRef, Geological Abstracts и BIOSIS. С 2008 г. входит в систему РИНЦ, включён в Russian Science Citation Index на платформе Web of Science. С 2019 г. индексируется в Scopus.

Публикует материалы о влиянии окружающей среды на физику живого организма, о трансформации энергии в организме, термодинамике. Значительное внимание уделяется моделированию внутриклеточных процессов и результатам математического анализа сложных биологических систем. Индексируется в системе SCOPUS и РИНЦ. Входит в базу данных Medline, в перечень российских рецензируемых научных журналов, в которых должны быть опубликованы основные научные результаты диссертаций на соискание ученых степеней доктора и кандидата наук.